La seconda metà dellOttocento ed il primo Novecento sono i periodi di maggiore sviluppo del Museo e delle ricerche nel campo della Biologia Animale. Inoltre il distacco della sezione di Anatomia comparata e il suo innalzamento a rango di Museo (1891) permettono la differenziazione dei filoni di ricerca e laffermazione di nuove figure di prestigio internazionale